水聲工程為國家重點學科，本學科所依托的國家級“水聲技術重點實驗室”作為我國水聲技術基礎研究最重要的研究單位之一，研究方向基本涵蓋了水聲技術的全部研究領域，基礎研究、應用技術研究、水聲裝備研制和系統集成技術研究等多方面和諧發展。該專業具有四個相對穩定、突出、優勢明顯的研究方向：聲納總體技術；信號處理；傳感器及聲系統；計量與測試技術。
專業介紹，由于聲波是在海水中探測目標、傳遞信息的有效工具，水聲工程在經濟建設中有著廣泛的應用，本所自1987年起開展水聲工程專業研究生培養工作，現已擁有該專業碩士學位授權點、博士學位授權點，形成了四個相對穩定、突出、優勢明顯的研究方向：
⑴聲納總體技術；
⑵信號處理；
⑶傳感器及聲系統；
⑷計量與測試技術。研究生畢業后可從事聲學、電子、計算機應用及信息工程的科研、教學工作，也可在漁業機械、石油、地質、海洋儀器、醫療儀器等部門從事設計、生產和科研工作。
水聲工程專業課程設置，自然辯證法概論、科學*理論與實踐、基礎英語、專業英語、矩陣理論、數理統計、聲學原理與噪聲控制、水聲學基礎、振動理論及其在工程中的應用、信號處理、數學物理方程、振動和聲學問題計算、水下噪聲學、代試驗技術、線性系統理論、最優估計理論與系統辨別、離散隨機信號處理、學術報告會。
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