南方科技大學是在中國高等教育改革發展的宏觀背景下，深圳市人民政府落實《國家中長期教育改革和發展規劃綱要》、《珠江三角洲地區改革發展規劃綱要(2008-2020)》要求，以新的思維和機制籌建的一所新大學。
南方科技大學是國家高等教育綜合改革試驗校，承載著探索中國培養創新人才模式的重任。學校以理、工學科為主，兼有部分文、管學科；在本科、碩士、博士多層次上辦學，一步到位按照亞洲一流標準組建專業學部和研究中心（所），建成類似加州理工學院和洛克菲勒大學那樣小規模高質量的研究型大學。
展望未來，南方科技大學將通過充分借鑒世界一流大學的辦學模式，創新辦學體制機制；建立健全學術自由的保障機制，加強教師在學校管理中的作用；轉變學校行政職能，增強行政服務意識和能力；重塑追求卓越，學術自由和學者自律的大學精神；努力建立現代大學人事制度，實行全員合同聘任制，構建起以學術為主導的學校內部管理體制。
校徽介紹與校名解讀
校徽
校徽的核心部分是一把火炬，象征南方科技大學的使命：為高等教育改革探索出一條新路。校徽背景為漸變的天青色，映襯火炬的照亮效果；此處的天青背景取自汝窯瓷釉，是中國傳統審美文化崇尚的色彩。
校名
“南方科技大學”由著名物理學家、諾貝爾獎獲得者李政道先生親筆題寫。李政道教授現任美國哥倫比亞大學教授、美國國家科學院院士、中國科學院首批外籍院士。1956年，李政道與楊振寧合作，共同提出弱相互作用中宇稱不守恒原理，而獲得1957年的諾貝爾物理學獎。李政道和楊振寧是最早獲諾貝爾獎的華人。
校名縮寫
SUSTC，字首SUST與sustainability一致，符合可持續發展的理念，此組合SUSTC亦直接對應南方科技大學英文校名(SouthUniversityofScienceandTechnologyofChina)。
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