2017年1月12日，中國科學評價研究中心（RCCSE）、武漢大學中國教育質量評價中心（ECCEQ）和中國科教評價網聯合發布了2017年中國大學本科院校綜合競爭力總排行榜，共涉及973所中國本科院校，比去年945所高校增加了28所(包括新建、合并、專升本等本科高校)。2017年新疆本科大學排名如下。
2017新疆本科大學排名
2017新疆本科大學排名中，新疆共計10所本科大學進入了全國高職院校排名800強，其中新疆大學排名第一，石河子大學排名第二。
| 排名 | 學校名稱 | 總得分 | 省市 | 省市排名 | 類型 | 類型排名 |
| 152 | 新疆大學 | 42.5 | 新疆 | 1 | 綜合 | 41 |
| 164 | 石河子大學 | 42.15 | 新疆 | 2 | 綜合 | 44 |
| 230 | 新疆醫科大學 | 40.29 | 新疆 | 3 | 醫藥 | 24 |
| 265 | 新疆師范大學 | 39.71 | 新疆 | 4 | 師范 | 33 |
| 286 | 新疆農業大學 | 39.17 | 新疆 | 5 | 農林 | 23 |
| 397 | 新疆財經大學 | 37.76 | 新疆 | 6 | 財經 | 28 |
| 521 | 伊犁師范學院 | 36.81 | 新疆 | 7 | 師范 | 68 |
| 556 | 塔里木大學 | 36.6 | 新疆 | 8 | 農林 | 35 |
| 644 | 喀什大學 | 36.13 | 新疆 | 9 | 師范 | 95 |
| 737 | 昌吉學院 | 35.72 | 新疆 | 10 | 師范 | 126 |
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